Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3C4

TPRKB, EKC/KEOPS complex subunit TPRKB, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRKBQ9Y3C4 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
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TPRKBQ9Y3C4 TRPA1-201ENST00000262209 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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TPRKBQ9Y3C4 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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TPRKBQ9Y3C4 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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TPRKBQ9Y3C4 TMEM121B-202ENST00000399875 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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TPRKBQ9Y3C4 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TPRKBQ9Y3C4 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TPRKBQ9Y3C4 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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TPRKBQ9Y3C4 SEC23A-201ENST00000307712 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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TPRKBQ9Y3C4 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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TPRKBQ9Y3C4 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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TPRKBQ9Y3C4 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TPRKBQ9Y3C4 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TPRKBQ9Y3C4 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TPRKBQ9Y3C4 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TPRKBQ9Y3C4 DHX37-201ENST00000308736 4550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TPRKBQ9Y3C4 YLPM1-207ENST00000552421 4899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TPRKBQ9Y3C4 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TPRKBQ9Y3C4 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TPRKBQ9Y3C4 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TPRKBQ9Y3C4 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TPRKBQ9Y3C4 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
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