Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X7

GIT1, ARF GTPase-activating protein GIT1, humanhuman

Predictions only

Length 761 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIT1Q9Y2X7 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GIT1Q9Y2X7 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GIT1Q9Y2X7 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GIT1Q9Y2X7 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GIT1Q9Y2X7 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GIT1Q9Y2X7 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GIT1Q9Y2X7 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GIT1Q9Y2X7 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GIT1Q9Y2X7 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GIT1Q9Y2X7 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GIT1Q9Y2X7 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GIT1Q9Y2X7 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GIT1Q9Y2X7 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GIT1Q9Y2X7 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GIT1Q9Y2X7 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GIT1Q9Y2X7 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GIT1Q9Y2X7 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GIT1Q9Y2X7 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GIT1Q9Y2X7 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GIT1Q9Y2X7 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GIT1Q9Y2X7 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GIT1Q9Y2X7 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GIT1Q9Y2X7 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GIT1Q9Y2X7 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GIT1Q9Y2X7 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GIT1Q9Y2X7 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GIT1Q9Y2X7 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GIT1Q9Y2X7 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GIT1Q9Y2X7 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GIT1Q9Y2X7 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GIT1Q9Y2X7 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GIT1Q9Y2X7 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GIT1Q9Y2X7 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GIT1Q9Y2X7 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GIT1Q9Y2X7 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GIT1Q9Y2X7 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GIT1Q9Y2X7 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GIT1Q9Y2X7 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GIT1Q9Y2X7 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GIT1Q9Y2X7 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GIT1Q9Y2X7 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GIT1Q9Y2X7 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GIT1Q9Y2X7 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GIT1Q9Y2X7 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GIT1Q9Y2X7 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GIT1Q9Y2X7 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GIT1Q9Y2X7 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GIT1Q9Y2X7 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GIT1Q9Y2X7 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GIT1Q9Y2X7 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GIT1Q9Y2X7 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GIT1Q9Y2X7 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GIT1Q9Y2X7 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GIT1Q9Y2X7 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GIT1Q9Y2X7 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GIT1Q9Y2X7 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GIT1Q9Y2X7 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GIT1Q9Y2X7 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GIT1Q9Y2X7 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GIT1Q9Y2X7 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GIT1Q9Y2X7 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GIT1Q9Y2X7 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GIT1Q9Y2X7 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GIT1Q9Y2X7 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GIT1Q9Y2X7 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GIT1Q9Y2X7 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GIT1Q9Y2X7 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GIT1Q9Y2X7 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GIT1Q9Y2X7 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GIT1Q9Y2X7 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GIT1Q9Y2X7 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GIT1Q9Y2X7 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GIT1Q9Y2X7 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GIT1Q9Y2X7 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GIT1Q9Y2X7 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GIT1Q9Y2X7 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GIT1Q9Y2X7 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GIT1Q9Y2X7 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GIT1Q9Y2X7 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GIT1Q9Y2X7 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GIT1Q9Y2X7 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GIT1Q9Y2X7 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GIT1Q9Y2X7 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GIT1Q9Y2X7 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GIT1Q9Y2X7 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GIT1Q9Y2X7 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GIT1Q9Y2X7 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GIT1Q9Y2X7 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GIT1Q9Y2X7 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GIT1Q9Y2X7 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GIT1Q9Y2X7 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GIT1Q9Y2X7 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GIT1Q9Y2X7 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GIT1Q9Y2X7 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GIT1Q9Y2X7 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GIT1Q9Y2X7 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GIT1Q9Y2X7 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GIT1Q9Y2X7 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GIT1Q9Y2X7 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GIT1Q9Y2X7 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms