Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
L1RE1Q9UN81 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms