Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLIP2Q9UDT6 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CLIP2Q9UDT6 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLIP2Q9UDT6 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLIP2Q9UDT6 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLIP2Q9UDT6 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLIP2Q9UDT6 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLIP2Q9UDT6 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLIP2Q9UDT6 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLIP2Q9UDT6 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLIP2Q9UDT6 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLIP2Q9UDT6 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLIP2Q9UDT6 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLIP2Q9UDT6 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLIP2Q9UDT6 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLIP2Q9UDT6 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLIP2Q9UDT6 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLIP2Q9UDT6 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLIP2Q9UDT6 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLIP2Q9UDT6 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLIP2Q9UDT6 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLIP2Q9UDT6 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLIP2Q9UDT6 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLIP2Q9UDT6 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLIP2Q9UDT6 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLIP2Q9UDT6 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLIP2Q9UDT6 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLIP2Q9UDT6 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLIP2Q9UDT6 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLIP2Q9UDT6 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CLIP2Q9UDT6 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLIP2Q9UDT6 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLIP2Q9UDT6 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLIP2Q9UDT6 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLIP2Q9UDT6 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLIP2Q9UDT6 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLIP2Q9UDT6 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLIP2Q9UDT6 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLIP2Q9UDT6 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CLIP2Q9UDT6 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLIP2Q9UDT6 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLIP2Q9UDT6 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLIP2Q9UDT6 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLIP2Q9UDT6 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLIP2Q9UDT6 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLIP2Q9UDT6 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CLIP2Q9UDT6 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLIP2Q9UDT6 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLIP2Q9UDT6 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLIP2Q9UDT6 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLIP2Q9UDT6 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLIP2Q9UDT6 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLIP2Q9UDT6 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLIP2Q9UDT6 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLIP2Q9UDT6 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLIP2Q9UDT6 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLIP2Q9UDT6 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLIP2Q9UDT6 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLIP2Q9UDT6 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLIP2Q9UDT6 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLIP2Q9UDT6 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLIP2Q9UDT6 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLIP2Q9UDT6 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLIP2Q9UDT6 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLIP2Q9UDT6 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLIP2Q9UDT6 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLIP2Q9UDT6 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLIP2Q9UDT6 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLIP2Q9UDT6 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLIP2Q9UDT6 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLIP2Q9UDT6 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLIP2Q9UDT6 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLIP2Q9UDT6 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLIP2Q9UDT6 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLIP2Q9UDT6 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLIP2Q9UDT6 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLIP2Q9UDT6 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLIP2Q9UDT6 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLIP2Q9UDT6 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLIP2Q9UDT6 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLIP2Q9UDT6 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLIP2Q9UDT6 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLIP2Q9UDT6 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLIP2Q9UDT6 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLIP2Q9UDT6 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLIP2Q9UDT6 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLIP2Q9UDT6 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLIP2Q9UDT6 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLIP2Q9UDT6 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLIP2Q9UDT6 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLIP2Q9UDT6 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLIP2Q9UDT6 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLIP2Q9UDT6 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CLIP2Q9UDT6 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLIP2Q9UDT6 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLIP2Q9UDT6 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLIP2Q9UDT6 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CLIP2Q9UDT6 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CLIP2Q9UDT6 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLIP2Q9UDT6 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.4 ms