Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
COPS7AQ9UBW8 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms