Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TFIP11Q9UBB9 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TFIP11Q9UBB9 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TFIP11Q9UBB9 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TFIP11Q9UBB9 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TFIP11Q9UBB9 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TFIP11Q9UBB9 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TFIP11Q9UBB9 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TFIP11Q9UBB9 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TFIP11Q9UBB9 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TFIP11Q9UBB9 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TFIP11Q9UBB9 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TFIP11Q9UBB9 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TFIP11Q9UBB9 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TFIP11Q9UBB9 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TFIP11Q9UBB9 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TFIP11Q9UBB9 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TFIP11Q9UBB9 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TFIP11Q9UBB9 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TFIP11Q9UBB9 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TFIP11Q9UBB9 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TFIP11Q9UBB9 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TFIP11Q9UBB9 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TFIP11Q9UBB9 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TFIP11Q9UBB9 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TFIP11Q9UBB9 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TFIP11Q9UBB9 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TFIP11Q9UBB9 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TFIP11Q9UBB9 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TFIP11Q9UBB9 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TFIP11Q9UBB9 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TFIP11Q9UBB9 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TFIP11Q9UBB9 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TFIP11Q9UBB9 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TFIP11Q9UBB9 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TFIP11Q9UBB9 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TFIP11Q9UBB9 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TFIP11Q9UBB9 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TFIP11Q9UBB9 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TFIP11Q9UBB9 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TFIP11Q9UBB9 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TFIP11Q9UBB9 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TFIP11Q9UBB9 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TFIP11Q9UBB9 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TFIP11Q9UBB9 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TFIP11Q9UBB9 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TFIP11Q9UBB9 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TFIP11Q9UBB9 RN7SL371P-201ENST00000578099 267 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TFIP11Q9UBB9 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
TFIP11Q9UBB9 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TFIP11Q9UBB9 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TFIP11Q9UBB9 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TFIP11Q9UBB9 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TFIP11Q9UBB9 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TFIP11Q9UBB9 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TFIP11Q9UBB9 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TFIP11Q9UBB9 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TFIP11Q9UBB9 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TFIP11Q9UBB9 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TFIP11Q9UBB9 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TFIP11Q9UBB9 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TFIP11Q9UBB9 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TFIP11Q9UBB9 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TFIP11Q9UBB9 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TFIP11Q9UBB9 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TFIP11Q9UBB9 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TFIP11Q9UBB9 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TFIP11Q9UBB9 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TFIP11Q9UBB9 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TFIP11Q9UBB9 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TFIP11Q9UBB9 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TFIP11Q9UBB9 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TFIP11Q9UBB9 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TFIP11Q9UBB9 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TFIP11Q9UBB9 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TFIP11Q9UBB9 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TFIP11Q9UBB9 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TFIP11Q9UBB9 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TFIP11Q9UBB9 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TFIP11Q9UBB9 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TFIP11Q9UBB9 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TFIP11Q9UBB9 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TFIP11Q9UBB9 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TFIP11Q9UBB9 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TFIP11Q9UBB9 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TFIP11Q9UBB9 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TFIP11Q9UBB9 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TFIP11Q9UBB9 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TFIP11Q9UBB9 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TFIP11Q9UBB9 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TFIP11Q9UBB9 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TFIP11Q9UBB9 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TFIP11Q9UBB9 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TFIP11Q9UBB9 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TFIP11Q9UBB9 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TFIP11Q9UBB9 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TFIP11Q9UBB9 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TFIP11Q9UBB9 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TFIP11Q9UBB9 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TFIP11Q9UBB9 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms