Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms