Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYS1

KRTAP1-5, Keratin-associated protein 1-5, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-5Q9BYS1 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP1-5Q9BYS1 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP1-5Q9BYS1 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP1-5Q9BYS1 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP1-5Q9BYS1 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP1-5Q9BYS1 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP1-5Q9BYS1 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP1-5Q9BYS1 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP1-5Q9BYS1 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP1-5Q9BYS1 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP1-5Q9BYS1 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP1-5Q9BYS1 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP1-5Q9BYS1 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP1-5Q9BYS1 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP1-5Q9BYS1 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP1-5Q9BYS1 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP1-5Q9BYS1 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP1-5Q9BYS1 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP1-5Q9BYS1 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP1-5Q9BYS1 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP1-5Q9BYS1 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP1-5Q9BYS1 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP1-5Q9BYS1 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP1-5Q9BYS1 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP1-5Q9BYS1 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP1-5Q9BYS1 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP1-5Q9BYS1 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP1-5Q9BYS1 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP1-5Q9BYS1 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP1-5Q9BYS1 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP1-5Q9BYS1 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP1-5Q9BYS1 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP1-5Q9BYS1 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP1-5Q9BYS1 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP1-5Q9BYS1 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP1-5Q9BYS1 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP1-5Q9BYS1 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP1-5Q9BYS1 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP1-5Q9BYS1 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP1-5Q9BYS1 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP1-5Q9BYS1 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP1-5Q9BYS1 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP1-5Q9BYS1 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP1-5Q9BYS1 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP1-5Q9BYS1 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP1-5Q9BYS1 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP1-5Q9BYS1 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP1-5Q9BYS1 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP1-5Q9BYS1 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP1-5Q9BYS1 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP1-5Q9BYS1 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP1-5Q9BYS1 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP1-5Q9BYS1 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP1-5Q9BYS1 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP1-5Q9BYS1 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP1-5Q9BYS1 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP1-5Q9BYS1 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP1-5Q9BYS1 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP1-5Q9BYS1 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP1-5Q9BYS1 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP1-5Q9BYS1 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP1-5Q9BYS1 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP1-5Q9BYS1 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP1-5Q9BYS1 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP1-5Q9BYS1 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP1-5Q9BYS1 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP1-5Q9BYS1 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP1-5Q9BYS1 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP1-5Q9BYS1 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP1-5Q9BYS1 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP1-5Q9BYS1 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP1-5Q9BYS1 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP1-5Q9BYS1 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP1-5Q9BYS1 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP1-5Q9BYS1 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP1-5Q9BYS1 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP1-5Q9BYS1 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP1-5Q9BYS1 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP1-5Q9BYS1 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP1-5Q9BYS1 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP1-5Q9BYS1 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP1-5Q9BYS1 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP1-5Q9BYS1 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP1-5Q9BYS1 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP1-5Q9BYS1 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP1-5Q9BYS1 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP1-5Q9BYS1 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP1-5Q9BYS1 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP1-5Q9BYS1 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP1-5Q9BYS1 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP1-5Q9BYS1 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP1-5Q9BYS1 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP1-5Q9BYS1 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP1-5Q9BYS1 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP1-5Q9BYS1 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP1-5Q9BYS1 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP1-5Q9BYS1 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP1-5Q9BYS1 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP1-5Q9BYS1 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP1-5Q9BYS1 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms