Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 GLIPR1L1-204ENST00000548623 484 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 AC090971.1-201ENST00000559302 510 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 PPME1-201ENST00000328257 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 TOLLIP-203ENST00000525159 3429 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 BRPF3-201ENST00000339717 4820 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 SRSF5-205ENST00000553635 1412 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 AMOTL2-202ENST00000422605 4335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 INTS6-201ENST00000311234 3662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 AP001999.1-201ENST00000513405 3684 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 DAAM2-202ENST00000398904 6224 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 CLUAP1-202ENST00000571025 5126 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 BCL2L11-221ENST00000621302 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 BCL2L11-222ENST00000622509 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 NCOR2-204ENST00000405201 8533 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 KIF21B-204ENST00000461742 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 AC055748.1-201ENST00000489836 959 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 AC107884.1-203ENST00000530846 628 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 LINC02424-201ENST00000548512 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 AC008764.5-201ENST00000597851 190 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 STX16-NPEPL1-202ENST00000530122 3433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 RRM2B-211ENST00000621845 3483 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 H3F3A-201ENST00000366813 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 NUTM2E-202ENST00000602967 3623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP4Q9BWG4 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.1 ms