Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HIRIP3Q9BW71 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms