Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSA9

TMEM175, Endosomal/lysosomal potassium channel TMEM175, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM175Q9BSA9 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM175Q9BSA9 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms