Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW8

NIPSNAP1, Protein NipSnap homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP1Q9BPW8 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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NIPSNAP1Q9BPW8 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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NIPSNAP1Q9BPW8 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NIPSNAP1Q9BPW8 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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