Protein–RNA interactions for Protein: Q99453

PHOX2B, Paired mesoderm homeobox protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2BQ99453 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PHOX2BQ99453 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PHOX2BQ99453 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PHOX2BQ99453 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PHOX2BQ99453 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PHOX2BQ99453 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PHOX2BQ99453 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PHOX2BQ99453 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PHOX2BQ99453 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PHOX2BQ99453 AC073987.1-201ENST00000422683 638 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PHOX2BQ99453 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PHOX2BQ99453 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PHOX2BQ99453 AC109454.2-201ENST00000503470 520 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PHOX2BQ99453 KLF3-AS1-203ENST00000504219 627 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PHOX2BQ99453 AC079949.1-201ENST00000541419 505 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PHOX2BQ99453 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PHOX2BQ99453 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PHOX2BQ99453 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PHOX2BQ99453 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PHOX2BQ99453 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PHOX2BQ99453 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PHOX2BQ99453 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PHOX2BQ99453 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PHOX2BQ99453 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PHOX2BQ99453 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PHOX2BQ99453 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
PHOX2BQ99453 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PHOX2BQ99453 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
PHOX2BQ99453 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PHOX2BQ99453 ATF4-203ENST00000404241 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
PHOX2BQ99453 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
PHOX2BQ99453 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
PHOX2BQ99453 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PHOX2BQ99453 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PHOX2BQ99453 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PHOX2BQ99453 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PHOX2BQ99453 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PHOX2BQ99453 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PHOX2BQ99453 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PHOX2BQ99453 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PHOX2BQ99453 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PHOX2BQ99453 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PHOX2BQ99453 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PHOX2BQ99453 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PHOX2BQ99453 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PHOX2BQ99453 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PHOX2BQ99453 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PHOX2BQ99453 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PHOX2BQ99453 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PHOX2BQ99453 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PHOX2BQ99453 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PHOX2BQ99453 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PHOX2BQ99453 ATXN3-201ENST00000340660 1205 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PHOX2BQ99453 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PHOX2BQ99453 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PHOX2BQ99453 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PHOX2BQ99453 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PHOX2BQ99453 PLA2G2A-202ENST00000400520 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PHOX2BQ99453 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PHOX2BQ99453 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PHOX2BQ99453 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PHOX2BQ99453 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PHOX2BQ99453 S100A2-205ENST00000487430 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PHOX2BQ99453 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PHOX2BQ99453 AC079035.1-201ENST00000551713 848 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PHOX2BQ99453 AC022087.1-201ENST00000558372 612 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PHOX2BQ99453 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PHOX2BQ99453 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PHOX2BQ99453 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PHOX2BQ99453 AC092953.2-201ENST00000608000 699 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PHOX2BQ99453 AC073575.2-201ENST00000614212 627 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PHOX2BQ99453 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PHOX2BQ99453 AC005785.2-201ENST00000624655 631 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PHOX2BQ99453 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PHOX2BQ99453 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PHOX2BQ99453 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PHOX2BQ99453 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PHOX2BQ99453 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PHOX2BQ99453 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PHOX2BQ99453 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PHOX2BQ99453 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PHOX2BQ99453 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PHOX2BQ99453 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PHOX2BQ99453 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PHOX2BQ99453 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PHOX2BQ99453 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PHOX2BQ99453 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PHOX2BQ99453 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PHOX2BQ99453 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PHOX2BQ99453 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PHOX2BQ99453 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PHOX2BQ99453 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHOX2BQ99453 SLC50A1-203ENST00000368404 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHOX2BQ99453 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHOX2BQ99453 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHOX2BQ99453 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHOX2BQ99453 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHOX2BQ99453 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHOX2BQ99453 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PHOX2BQ99453 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms