Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB3

HIC2, Hypermethylated in cancer 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIC2Q96JB3 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC15.02■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.02■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
HIC2Q96JB3 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms