Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BORCS6Q96GS4 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms