Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C18orf8Q96DM3 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.9 ms