Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF65

GIPC2, PDZ domain-containing protein GIPC2, humanhuman

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC2Q8TF65 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GIPC2Q8TF65 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GIPC2Q8TF65 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GIPC2Q8TF65 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GIPC2Q8TF65 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GIPC2Q8TF65 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GIPC2Q8TF65 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GIPC2Q8TF65 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GIPC2Q8TF65 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GIPC2Q8TF65 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GIPC2Q8TF65 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GIPC2Q8TF65 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GIPC2Q8TF65 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GIPC2Q8TF65 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GIPC2Q8TF65 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GIPC2Q8TF65 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GIPC2Q8TF65 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GIPC2Q8TF65 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GIPC2Q8TF65 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GIPC2Q8TF65 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GIPC2Q8TF65 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GIPC2Q8TF65 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GIPC2Q8TF65 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GIPC2Q8TF65 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GIPC2Q8TF65 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GIPC2Q8TF65 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GIPC2Q8TF65 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GIPC2Q8TF65 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GIPC2Q8TF65 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GIPC2Q8TF65 SSR1P1-201ENST00000407630 814 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GIPC2Q8TF65 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GIPC2Q8TF65 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GIPC2Q8TF65 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GIPC2Q8TF65 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GIPC2Q8TF65 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GIPC2Q8TF65 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GIPC2Q8TF65 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GIPC2Q8TF65 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GIPC2Q8TF65 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GIPC2Q8TF65 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GIPC2Q8TF65 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GIPC2Q8TF65 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GIPC2Q8TF65 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GIPC2Q8TF65 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GIPC2Q8TF65 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GIPC2Q8TF65 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GIPC2Q8TF65 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GIPC2Q8TF65 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GIPC2Q8TF65 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GIPC2Q8TF65 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GIPC2Q8TF65 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GIPC2Q8TF65 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GIPC2Q8TF65 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GIPC2Q8TF65 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GIPC2Q8TF65 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GIPC2Q8TF65 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GIPC2Q8TF65 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GIPC2Q8TF65 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GIPC2Q8TF65 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GIPC2Q8TF65 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GIPC2Q8TF65 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GIPC2Q8TF65 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GIPC2Q8TF65 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GIPC2Q8TF65 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GIPC2Q8TF65 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GIPC2Q8TF65 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GIPC2Q8TF65 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GIPC2Q8TF65 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GIPC2Q8TF65 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GIPC2Q8TF65 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GIPC2Q8TF65 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GIPC2Q8TF65 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GIPC2Q8TF65 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GIPC2Q8TF65 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GIPC2Q8TF65 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GIPC2Q8TF65 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GIPC2Q8TF65 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GIPC2Q8TF65 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GIPC2Q8TF65 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GIPC2Q8TF65 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GIPC2Q8TF65 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GIPC2Q8TF65 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GIPC2Q8TF65 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GIPC2Q8TF65 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GIPC2Q8TF65 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GIPC2Q8TF65 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GIPC2Q8TF65 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GIPC2Q8TF65 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GIPC2Q8TF65 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GIPC2Q8TF65 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GIPC2Q8TF65 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GIPC2Q8TF65 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GIPC2Q8TF65 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GIPC2Q8TF65 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GIPC2Q8TF65 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GIPC2Q8TF65 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GIPC2Q8TF65 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GIPC2Q8TF65 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GIPC2Q8TF65 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GIPC2Q8TF65 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms