Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAS9

C5orf17, Uncharacterized protein C5orf17, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf17Q8NAS9 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
C5orf17Q8NAS9 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
C5orf17Q8NAS9 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
C5orf17Q8NAS9 TGM2-201ENST00000361475 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
C5orf17Q8NAS9 CACNA1G-222ENST00000510366 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
C5orf17Q8NAS9 CACNA1G-227ENST00000513964 6735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
C5orf17Q8NAS9 CCBE1-201ENST00000398179 5979 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
C5orf17Q8NAS9 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
C5orf17Q8NAS9 SCARB2-215ENST00000639145 4471 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
C5orf17Q8NAS9 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
C5orf17Q8NAS9 EIF3A-201ENST00000369144 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
C5orf17Q8NAS9 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
C5orf17Q8NAS9 FLNA-203ENST00000369850 8382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
C5orf17Q8NAS9 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
C5orf17Q8NAS9 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
C5orf17Q8NAS9 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
C5orf17Q8NAS9 ARPIN-201ENST00000357484 7591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
C5orf17Q8NAS9 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
C5orf17Q8NAS9 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
C5orf17Q8NAS9 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
C5orf17Q8NAS9 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
C5orf17Q8NAS9 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
C5orf17Q8NAS9 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
C5orf17Q8NAS9 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
C5orf17Q8NAS9 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
C5orf17Q8NAS9 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
C5orf17Q8NAS9 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
C5orf17Q8NAS9 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC11.42□□□□□ -0.58
C5orf17Q8NAS9 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
C5orf17Q8NAS9 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
C5orf17Q8NAS9 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
C5orf17Q8NAS9 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
C5orf17Q8NAS9 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
C5orf17Q8NAS9 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
C5orf17Q8NAS9 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
C5orf17Q8NAS9 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
C5orf17Q8NAS9 YIPF6-201ENST00000374622 6134 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
C5orf17Q8NAS9 TLR6-202ENST00000436693 5880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
C5orf17Q8NAS9 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
C5orf17Q8NAS9 SMC6-201ENST00000351948 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
C5orf17Q8NAS9 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
C5orf17Q8NAS9 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
C5orf17Q8NAS9 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
C5orf17Q8NAS9 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
C5orf17Q8NAS9 ZNF519-206ENST00000589498 2117 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
C5orf17Q8NAS9 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
C5orf17Q8NAS9 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
C5orf17Q8NAS9 SYBU-204ENST00000408908 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
C5orf17Q8NAS9 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
C5orf17Q8NAS9 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
C5orf17Q8NAS9 AC090114.2-201ENST00000608477 7054 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
C5orf17Q8NAS9 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
C5orf17Q8NAS9 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
C5orf17Q8NAS9 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
C5orf17Q8NAS9 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
C5orf17Q8NAS9 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C5orf17Q8NAS9 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
C5orf17Q8NAS9 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
C5orf17Q8NAS9 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C5orf17Q8NAS9 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
C5orf17Q8NAS9 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
C5orf17Q8NAS9 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
C5orf17Q8NAS9 AC104129.1-202ENST00000480694 4481 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
C5orf17Q8NAS9 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C5orf17Q8NAS9 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C5orf17Q8NAS9 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C5orf17Q8NAS9 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
C5orf17Q8NAS9 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C5orf17Q8NAS9 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C5orf17Q8NAS9 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
C5orf17Q8NAS9 NHSL1-204ENST00000427025 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
C5orf17Q8NAS9 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
C5orf17Q8NAS9 CPLX2-201ENST00000359546 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C5orf17Q8NAS9 ROBO1-213ENST00000618846 7483 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
C5orf17Q8NAS9 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
C5orf17Q8NAS9 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
C5orf17Q8NAS9 AMER3-202ENST00000423981 6172 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.41□□□□□ -0.58
C5orf17Q8NAS9 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C5orf17Q8NAS9 RAB6B-201ENST00000285208 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C5orf17Q8NAS9 CDH11-201ENST00000268603 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C5orf17Q8NAS9 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C5orf17Q8NAS9 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
C5orf17Q8NAS9 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C5orf17Q8NAS9 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C5orf17Q8NAS9 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C5orf17Q8NAS9 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
C5orf17Q8NAS9 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C5orf17Q8NAS9 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C5orf17Q8NAS9 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C5orf17Q8NAS9 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C5orf17Q8NAS9 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C5orf17Q8NAS9 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C5orf17Q8NAS9 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C5orf17Q8NAS9 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
C5orf17Q8NAS9 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
C5orf17Q8NAS9 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
C5orf17Q8NAS9 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC11.41□□□□□ -0.58
C5orf17Q8NAS9 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
C5orf17Q8NAS9 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
C5orf17Q8NAS9 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms