Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4P3

HDDC3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, humanhuman

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC3Q8N4P3 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HDDC3Q8N4P3 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
HDDC3Q8N4P3 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HDDC3Q8N4P3 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HDDC3Q8N4P3 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HDDC3Q8N4P3 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
HDDC3Q8N4P3 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HDDC3Q8N4P3 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
HDDC3Q8N4P3 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
HDDC3Q8N4P3 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HDDC3Q8N4P3 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
HDDC3Q8N4P3 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
HDDC3Q8N4P3 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HDDC3Q8N4P3 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HDDC3Q8N4P3 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HDDC3Q8N4P3 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HDDC3Q8N4P3 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HDDC3Q8N4P3 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HDDC3Q8N4P3 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HDDC3Q8N4P3 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HDDC3Q8N4P3 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HDDC3Q8N4P3 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HDDC3Q8N4P3 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HDDC3Q8N4P3 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HDDC3Q8N4P3 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HDDC3Q8N4P3 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HDDC3Q8N4P3 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDDC3Q8N4P3 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDDC3Q8N4P3 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDDC3Q8N4P3 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDDC3Q8N4P3 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDDC3Q8N4P3 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDDC3Q8N4P3 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDDC3Q8N4P3 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDDC3Q8N4P3 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDDC3Q8N4P3 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDDC3Q8N4P3 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDDC3Q8N4P3 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDDC3Q8N4P3 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDDC3Q8N4P3 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDDC3Q8N4P3 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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HDDC3Q8N4P3 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDDC3Q8N4P3 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDDC3Q8N4P3 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDDC3Q8N4P3 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDDC3Q8N4P3 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDDC3Q8N4P3 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDDC3Q8N4P3 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDDC3Q8N4P3 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDDC3Q8N4P3 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDDC3Q8N4P3 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDDC3Q8N4P3 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDDC3Q8N4P3 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDDC3Q8N4P3 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
HDDC3Q8N4P3 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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HDDC3Q8N4P3 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDDC3Q8N4P3 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDDC3Q8N4P3 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDDC3Q8N4P3 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDDC3Q8N4P3 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDDC3Q8N4P3 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDDC3Q8N4P3 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDDC3Q8N4P3 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDDC3Q8N4P3 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HDDC3Q8N4P3 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HDDC3Q8N4P3 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HDDC3Q8N4P3 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HDDC3Q8N4P3 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HDDC3Q8N4P3 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HDDC3Q8N4P3 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HDDC3Q8N4P3 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HDDC3Q8N4P3 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HDDC3Q8N4P3 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HDDC3Q8N4P3 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HDDC3Q8N4P3 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HDDC3Q8N4P3 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HDDC3Q8N4P3 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HDDC3Q8N4P3 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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