Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 TP73-203ENST00000357733 4899 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC117Q8IWD4 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC117Q8IWD4 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC117Q8IWD4 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC117Q8IWD4 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC117Q8IWD4 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC117Q8IWD4 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC117Q8IWD4 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC117Q8IWD4 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC117Q8IWD4 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC117Q8IWD4 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC117Q8IWD4 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC117Q8IWD4 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC117Q8IWD4 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC117Q8IWD4 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC117Q8IWD4 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC117Q8IWD4 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC117Q8IWD4 TECPR1-204ENST00000447648 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC117Q8IWD4 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC117Q8IWD4 Z83844.1-201ENST00000455236 4904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC117Q8IWD4 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC117Q8IWD4 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC117Q8IWD4 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC117Q8IWD4 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC117Q8IWD4 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC117Q8IWD4 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC117Q8IWD4 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC117Q8IWD4 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC117Q8IWD4 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC117Q8IWD4 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC117Q8IWD4 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC117Q8IWD4 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC117Q8IWD4 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC117Q8IWD4 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC117Q8IWD4 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC117Q8IWD4 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC117Q8IWD4 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC117Q8IWD4 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC117Q8IWD4 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC117Q8IWD4 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC117Q8IWD4 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC117Q8IWD4 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC117Q8IWD4 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC117Q8IWD4 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC117Q8IWD4 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC117Q8IWD4 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC117Q8IWD4 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC117Q8IWD4 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC117Q8IWD4 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC117Q8IWD4 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC117Q8IWD4 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC117Q8IWD4 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC117Q8IWD4 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC117Q8IWD4 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC117Q8IWD4 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC117Q8IWD4 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC117Q8IWD4 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC117Q8IWD4 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC117Q8IWD4 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC117Q8IWD4 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC117Q8IWD4 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC117Q8IWD4 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC117Q8IWD4 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC117Q8IWD4 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC117Q8IWD4 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC117Q8IWD4 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC117Q8IWD4 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC117Q8IWD4 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC117Q8IWD4 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC117Q8IWD4 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC117Q8IWD4 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC117Q8IWD4 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC117Q8IWD4 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC117Q8IWD4 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC117Q8IWD4 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC117Q8IWD4 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC117Q8IWD4 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC117Q8IWD4 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC117Q8IWD4 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC117Q8IWD4 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC117Q8IWD4 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC117Q8IWD4 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC117Q8IWD4 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC117Q8IWD4 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC117Q8IWD4 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC117Q8IWD4 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC117Q8IWD4 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC117Q8IWD4 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC117Q8IWD4 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC117Q8IWD4 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC117Q8IWD4 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC117Q8IWD4 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC117Q8IWD4 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC117Q8IWD4 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC117Q8IWD4 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC117Q8IWD4 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC117Q8IWD4 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC117Q8IWD4 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC117Q8IWD4 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC117Q8IWD4 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms