Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6K3

PTAR1, Protein prenyltransferase alpha subunit repeat-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAR1Q7Z6K3 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTAR1Q7Z6K3 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTAR1Q7Z6K3 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTAR1Q7Z6K3 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTAR1Q7Z6K3 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PTAR1Q7Z6K3 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTAR1Q7Z6K3 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTAR1Q7Z6K3 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTAR1Q7Z6K3 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTAR1Q7Z6K3 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTAR1Q7Z6K3 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PTAR1Q7Z6K3 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTAR1Q7Z6K3 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTAR1Q7Z6K3 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PTAR1Q7Z6K3 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTAR1Q7Z6K3 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTAR1Q7Z6K3 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PTAR1Q7Z6K3 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTAR1Q7Z6K3 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PTAR1Q7Z6K3 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTAR1Q7Z6K3 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTAR1Q7Z6K3 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTAR1Q7Z6K3 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTAR1Q7Z6K3 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTAR1Q7Z6K3 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PTAR1Q7Z6K3 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTAR1Q7Z6K3 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTAR1Q7Z6K3 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTAR1Q7Z6K3 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTAR1Q7Z6K3 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTAR1Q7Z6K3 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTAR1Q7Z6K3 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTAR1Q7Z6K3 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTAR1Q7Z6K3 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTAR1Q7Z6K3 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTAR1Q7Z6K3 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PTAR1Q7Z6K3 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PTAR1Q7Z6K3 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PTAR1Q7Z6K3 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PTAR1Q7Z6K3 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PTAR1Q7Z6K3 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PTAR1Q7Z6K3 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PTAR1Q7Z6K3 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PTAR1Q7Z6K3 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PTAR1Q7Z6K3 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PTAR1Q7Z6K3 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PTAR1Q7Z6K3 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PTAR1Q7Z6K3 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PTAR1Q7Z6K3 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PTAR1Q7Z6K3 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTAR1Q7Z6K3 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PTAR1Q7Z6K3 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTAR1Q7Z6K3 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTAR1Q7Z6K3 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTAR1Q7Z6K3 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTAR1Q7Z6K3 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTAR1Q7Z6K3 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTAR1Q7Z6K3 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
PTAR1Q7Z6K3 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PTAR1Q7Z6K3 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PTAR1Q7Z6K3 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PTAR1Q7Z6K3 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PTAR1Q7Z6K3 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PTAR1Q7Z6K3 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PTAR1Q7Z6K3 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PTAR1Q7Z6K3 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTAR1Q7Z6K3 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTAR1Q7Z6K3 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PTAR1Q7Z6K3 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PTAR1Q7Z6K3 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PTAR1Q7Z6K3 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PTAR1Q7Z6K3 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PTAR1Q7Z6K3 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PTAR1Q7Z6K3 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PTAR1Q7Z6K3 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PTAR1Q7Z6K3 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PTAR1Q7Z6K3 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PTAR1Q7Z6K3 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PTAR1Q7Z6K3 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PTAR1Q7Z6K3 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PTAR1Q7Z6K3 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PTAR1Q7Z6K3 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTAR1Q7Z6K3 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PTAR1Q7Z6K3 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTAR1Q7Z6K3 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTAR1Q7Z6K3 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTAR1Q7Z6K3 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PTAR1Q7Z6K3 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTAR1Q7Z6K3 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTAR1Q7Z6K3 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PTAR1Q7Z6K3 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTAR1Q7Z6K3 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTAR1Q7Z6K3 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PTAR1Q7Z6K3 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTAR1Q7Z6K3 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTAR1Q7Z6K3 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTAR1Q7Z6K3 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PTAR1Q7Z6K3 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PTAR1Q7Z6K3 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
PTAR1Q7Z6K3 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms