Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXI9

NPNT, Nephronectin, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPNTQ6UXI9 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPNTQ6UXI9 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NPNTQ6UXI9 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPNTQ6UXI9 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPNTQ6UXI9 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPNTQ6UXI9 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPNTQ6UXI9 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPNTQ6UXI9 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPNTQ6UXI9 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NPNTQ6UXI9 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPNTQ6UXI9 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPNTQ6UXI9 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPNTQ6UXI9 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPNTQ6UXI9 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPNTQ6UXI9 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPNTQ6UXI9 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NPNTQ6UXI9 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPNTQ6UXI9 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPNTQ6UXI9 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPNTQ6UXI9 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPNTQ6UXI9 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPNTQ6UXI9 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPNTQ6UXI9 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPNTQ6UXI9 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPNTQ6UXI9 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPNTQ6UXI9 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPNTQ6UXI9 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPNTQ6UXI9 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPNTQ6UXI9 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPNTQ6UXI9 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPNTQ6UXI9 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPNTQ6UXI9 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPNTQ6UXI9 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPNTQ6UXI9 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPNTQ6UXI9 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPNTQ6UXI9 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPNTQ6UXI9 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPNTQ6UXI9 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPNTQ6UXI9 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPNTQ6UXI9 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPNTQ6UXI9 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPNTQ6UXI9 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPNTQ6UXI9 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPNTQ6UXI9 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPNTQ6UXI9 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPNTQ6UXI9 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPNTQ6UXI9 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPNTQ6UXI9 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NPNTQ6UXI9 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPNTQ6UXI9 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPNTQ6UXI9 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPNTQ6UXI9 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPNTQ6UXI9 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPNTQ6UXI9 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPNTQ6UXI9 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPNTQ6UXI9 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPNTQ6UXI9 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPNTQ6UXI9 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPNTQ6UXI9 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPNTQ6UXI9 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPNTQ6UXI9 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPNTQ6UXI9 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPNTQ6UXI9 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPNTQ6UXI9 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPNTQ6UXI9 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPNTQ6UXI9 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPNTQ6UXI9 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPNTQ6UXI9 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPNTQ6UXI9 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NPNTQ6UXI9 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPNTQ6UXI9 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPNTQ6UXI9 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NPNTQ6UXI9 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPNTQ6UXI9 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPNTQ6UXI9 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPNTQ6UXI9 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPNTQ6UXI9 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPNTQ6UXI9 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPNTQ6UXI9 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPNTQ6UXI9 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPNTQ6UXI9 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPNTQ6UXI9 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPNTQ6UXI9 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPNTQ6UXI9 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPNTQ6UXI9 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPNTQ6UXI9 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NPNTQ6UXI9 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPNTQ6UXI9 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPNTQ6UXI9 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPNTQ6UXI9 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPNTQ6UXI9 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPNTQ6UXI9 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPNTQ6UXI9 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPNTQ6UXI9 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPNTQ6UXI9 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPNTQ6UXI9 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NPNTQ6UXI9 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPNTQ6UXI9 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NPNTQ6UXI9 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPNTQ6UXI9 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.1 ms