Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 AP001972.5-201ENST00000624624 2338 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 PJA1-203ENST00000374583 2692 ntAPPRIS P4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 RAB37-204ENST00000392613 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 COL2A1-201ENST00000337299 4257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 TMC8-201ENST00000318430 4411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 TFIP11-201ENST00000405938 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 MCL1-204ENST00000620947 3626 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 LIPE-201ENST00000244289 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 MARVELD2-201ENST00000325631 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 C17orf53-203ENST00000585683 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 SLC26A6-202ENST00000337000 2317 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 AC127496.1-201ENST00000576234 3133 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 NTNG1-204ENST00000370067 4628 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 TMC5-204ENST00000541464 3581 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 SFI1-229ENST00000540643 4226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 CALD1-205ENST00000422748 2665 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 RPL31-207ENST00000409711 2328 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 IGFN1-201ENST00000295591 4439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 DPP10-201ENST00000310323 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 ADRA2B-201ENST00000620793 3371 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CCBE1Q6UXH8 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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