Protein–RNA interactions for Protein: Q658N2

WSCD1, WSC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WSCD1Q658N2 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms