Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 FP325330.2-201ENST00000624219 5630 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 USP40-201ENST00000251722 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 OR4K13-203ENST00000641904 5684 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 TCF23-201ENST00000296096 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 ADD2-202ENST00000355733 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 MON1B-201ENST00000248248 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 TP53INP1-202ENST00000448464 5631 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 ARNTL-202ENST00000401424 2788 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
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SAMD13Q5VXD3 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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SAMD13Q5VXD3 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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SAMD13Q5VXD3 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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SAMD13Q5VXD3 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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SAMD13Q5VXD3 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
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SAMD13Q5VXD3 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
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SAMD13Q5VXD3 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 BAIAP2-202ENST00000321300 2879 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 ELN-211ENST00000414324 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 C5AR1-201ENST00000355085 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SAMD13Q5VXD3 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
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