Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 FLAD1-202ENST00000295530 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 CASP2-203ENST00000392925 616 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 IP6K2-223ENST00000453202 571 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 MBP-230ENST00000528160 584 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 AC132812.1-201ENST00000583145 892 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 EMP3-204ENST00000596315 761 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 PRR20FP-201ENST00000603320 180 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 AC087072.1-201ENST00000603727 421 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 AL450487.2-201ENST00000615934 407 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 AC009041.4-201ENST00000620075 638 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 AL513478.2-202ENST00000621949 835 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 TPPP3-205ENST00000564104 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 RPAIN-202ENST00000381208 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 LILRP2-202ENST00000413572 1383 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 FCN2-202ENST00000350339 943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 GLRX2-202ENST00000367440 1131 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 MYL4-202ENST00000393450 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 GULOP-201ENST00000454030 748 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 AC008440.1-201ENST00000455835 439 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 RPSAP70-201ENST00000504462 864 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 HNRNPA1P56-201ENST00000505767 954 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 CRYBB2P1-204ENST00000509460 701 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 AC137579.2-201ENST00000517714 551 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 KRTAP10-4-202ENST00000616689 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 AL353658.2-201ENST00000629794 519 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 AC005736.3-201ENST00000571169 244 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 Metazoa_SRP.63-201ENST00000617144 298 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 CBR3-AS1-210ENST00000623484 392 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 CBR3-AS1-215ENST00000624086 594 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 LINC01012-203ENST00000628762 743 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
FRMPD1Q5SYB0 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 C6orf48-202ENST00000375635 610 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 C6orf48-209ENST00000395789 952 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 TRAPPC4-202ENST00000434101 794 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 SNHG4-204ENST00000507197 865 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 AC002996.1-201ENST00000546840 784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 HIGD2A-201ENST00000274787 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 AC068631.1-228ENST00000354642 742 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 KRT18P44-201ENST00000416086 1285 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 AC092295.1-201ENST00000446262 434 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 AC093700.1-201ENST00000503348 717 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 AC112250.1-201ENST00000504640 745 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
FRMPD1Q5SYB0 TBC1D3P6-201ENST00000505954 962 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms