Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 SNED1-205ENST00000405547 7986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 EPHB1-201ENST00000398015 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 PLA2G4F-202ENST00000397272 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 SFI1-229ENST00000540643 4226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 SOGA3-207ENST00000481848 11464 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 FLNA-201ENST00000344736 7932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 ARHGAP31-201ENST00000264245 9317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 ADGRG6-204ENST00000367609 6887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 SLC4A7-203ENST00000425128 7970 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
KLHL12Q53G59 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.4 ms