Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTXN3Q4LDR2 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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