Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 TRPM5-202ENST00000528453 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 RBM15-205ENST00000618772 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 MCFD2-212ENST00000444761 4169 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 TUBGCP5-208ENST00000620435 3342 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 TEX35-204ENST00000367642 2452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 DRD2-210ENST00000544518 2473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 NAALADL1-201ENST00000340252 2376 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 TRAPPC9-201ENST00000389328 4474 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 AC004241.1-201ENST00000547799 3299 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 DGKZ-216ENST00000528615 2692 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 LILRB1-203ENST00000396317 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 TESMIN-204ENST00000443940 3495 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 ARFIP2-210ENST00000614314 3846 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 PLCB3-201ENST00000279230 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 RFWD3-201ENST00000361070 4957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 ARHGEF2-206ENST00000462460 4438 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 BCRP2-203ENST00000461808 1832 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 LCA5-202ENST00000392959 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 ZMPSTE24-201ENST00000372759 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 RBM10-206ENST00000628161 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 BDH1-202ENST00000392378 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 SLC26A6-205ENST00000395550 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 AL031719.1-201ENST00000623365 2587 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 CCT3-211ENST00000472765 1858 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 SLFNL1-AS1-201ENST00000626479 4800 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 PDE4A-204ENST00000440014 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 ASB2-201ENST00000315988 2743 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 VWA5B2-201ENST00000273794 3486 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms