Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI63

KRTAP20-1, Keratin-associated protein 20-1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-1Q3LI63 HTR3D-203ENST00000428798 1215 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP20-1Q3LI63 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP20-1Q3LI63 MIR646HG-206ENST00000431181 858 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP20-1Q3LI63 AC004870.4-202ENST00000433337 455 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP20-1Q3LI63 AP001631.1-201ENST00000433840 1052 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP20-1Q3LI63 CIDECP-205ENST00000433871 770 ntBASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP20-1Q3LI63 AC084809.1-201ENST00000435733 591 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP20-1Q3LI63 AL035252.1-201ENST00000440642 895 ntBASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP20-1Q3LI63 CFL1P2-201ENST00000440986 684 ntBASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP20-1Q3LI63 TIMM23B-202ENST00000451577 1152 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP20-1Q3LI63 FDPS-206ENST00000467076 1178 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP20-1Q3LI63 LINC01100-201ENST00000471921 740 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP20-1Q3LI63 AC022364.1-201ENST00000473753 739 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP20-1Q3LI63 RN7SL16P-201ENST00000476316 269 ntBASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP20-1Q3LI63 FHIT-205ENST00000476844 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP20-1Q3LI63 BPI-205ENST00000479646 383 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP20-1Q3LI63 RN7SL328P-201ENST00000484033 300 ntBASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP20-1Q3LI63 NDUFA13-204ENST00000507754 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP20-1Q3LI63 BCRP5-201ENST00000514371 253 ntBASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP20-1Q3LI63 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP20-1Q3LI63 AC099730.1-201ENST00000525269 1177 ntBASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP20-1Q3LI63 AP001102.1-201ENST00000528959 409 ntBASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP20-1Q3LI63 AP001972.4-201ENST00000530550 560 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP20-1Q3LI63 RBP5-202ENST00000542370 564 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP20-1Q3LI63 ENSAP2-201ENST00000554405 352 ntBASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP20-1Q3LI63 AC133539.1-201ENST00000562644 420 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP20-1Q3LI63 AC090282.1-201ENST00000572821 534 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP20-1Q3LI63 ZNF581-204ENST00000588537 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP20-1Q3LI63 AC020904.1-201ENST00000594322 729 ntBASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP20-1Q3LI63 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP20-1Q3LI63 MEG8_2.1-201ENST00000610604 122 ntBASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP20-1Q3LI63 RN7SL341P-201ENST00000613745 298 ntBASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP20-1Q3LI63 AL138689.1-201ENST00000614612 668 ntBASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP20-1Q3LI63 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP20-1Q3LI63 DPP6-216ENST00000619756 1109 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP20-1Q3LI63 FP236240.2-201ENST00000623896 1052 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP20-1Q3LI63 LINC01669-203ENST00000624105 505 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP20-1Q3LI63 LIN28B-AS1-204ENST00000636951 610 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP20-1Q3LI63 FAM240B-202ENST00000637691 966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP20-1Q3LI63 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP20-1Q3LI63 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP20-1Q3LI63 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP20-1Q3LI63 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP20-1Q3LI63 AGFG1-203ENST00000409171 1783 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP20-1Q3LI63 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP20-1Q3LI63 LPGAT1-201ENST00000366996 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP20-1Q3LI63 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP20-1Q3LI63 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP20-1Q3LI63 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP20-1Q3LI63 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP20-1Q3LI63 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP20-1Q3LI63 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP20-1Q3LI63 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP20-1Q3LI63 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP20-1Q3LI63 CCDC181-202ENST00000367806 1860 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP20-1Q3LI63 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP20-1Q3LI63 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP20-1Q3LI63 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP20-1Q3LI63 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP20-1Q3LI63 NFATC4-212ENST00000554473 1382 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP20-1Q3LI63 AC005519.2-201ENST00000554532 1367 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP20-1Q3LI63 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP20-1Q3LI63 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP20-1Q3LI63 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP20-1Q3LI63 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP20-1Q3LI63 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP20-1Q3LI63 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP20-1Q3LI63 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP20-1Q3LI63 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP20-1Q3LI63 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP20-1Q3LI63 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP20-1Q3LI63 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP20-1Q3LI63 A1BG-AS1-203ENST00000594950 1718 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP20-1Q3LI63 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP20-1Q3LI63 TUBD1-203ENST00000346141 1490 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP20-1Q3LI63 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP20-1Q3LI63 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP20-1Q3LI63 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP20-1Q3LI63 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP20-1Q3LI63 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP20-1Q3LI63 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP20-1Q3LI63 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP20-1Q3LI63 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP20-1Q3LI63 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP20-1Q3LI63 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP20-1Q3LI63 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP20-1Q3LI63 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP20-1Q3LI63 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP20-1Q3LI63 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
KRTAP20-1Q3LI63 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
KRTAP20-1Q3LI63 FAM27E3-201ENST00000418795 1593 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
KRTAP20-1Q3LI63 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
KRTAP20-1Q3LI63 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
KRTAP20-1Q3LI63 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
KRTAP20-1Q3LI63 AL512590.2-201ENST00000531758 1341 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
KRTAP20-1Q3LI63 LAMTOR1-204ENST00000538404 1346 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
KRTAP20-1Q3LI63 AC099689.1-201ENST00000624383 1302 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
KRTAP20-1Q3LI63 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
KRTAP20-1Q3LI63 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
KRTAP20-1Q3LI63 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms