Protein–RNA interactions for Protein: Q2Q1W2

TRIM71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 868 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM71Q2Q1W2 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM71Q2Q1W2 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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