Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NDUFA9Q16795 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NDUFA9Q16795 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NDUFA9Q16795 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NDUFA9Q16795 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NDUFA9Q16795 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NDUFA9Q16795 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NDUFA9Q16795 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NDUFA9Q16795 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NDUFA9Q16795 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NDUFA9Q16795 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
NDUFA9Q16795 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NDUFA9Q16795 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NDUFA9Q16795 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NDUFA9Q16795 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NDUFA9Q16795 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NDUFA9Q16795 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NDUFA9Q16795 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NDUFA9Q16795 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
NDUFA9Q16795 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NDUFA9Q16795 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NDUFA9Q16795 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NDUFA9Q16795 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NDUFA9Q16795 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NDUFA9Q16795 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NDUFA9Q16795 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NDUFA9Q16795 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NDUFA9Q16795 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NDUFA9Q16795 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NDUFA9Q16795 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NDUFA9Q16795 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NDUFA9Q16795 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NDUFA9Q16795 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NDUFA9Q16795 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NDUFA9Q16795 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NDUFA9Q16795 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NDUFA9Q16795 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NDUFA9Q16795 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NDUFA9Q16795 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NDUFA9Q16795 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NDUFA9Q16795 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NDUFA9Q16795 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NDUFA9Q16795 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NDUFA9Q16795 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NDUFA9Q16795 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NDUFA9Q16795 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NDUFA9Q16795 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
NDUFA9Q16795 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NDUFA9Q16795 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NDUFA9Q16795 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NDUFA9Q16795 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NDUFA9Q16795 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NDUFA9Q16795 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NDUFA9Q16795 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NDUFA9Q16795 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
NDUFA9Q16795 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NDUFA9Q16795 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NDUFA9Q16795 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NDUFA9Q16795 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NDUFA9Q16795 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NDUFA9Q16795 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NDUFA9Q16795 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NDUFA9Q16795 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NDUFA9Q16795 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NDUFA9Q16795 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NDUFA9Q16795 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
NDUFA9Q16795 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
NDUFA9Q16795 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NDUFA9Q16795 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NDUFA9Q16795 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
NDUFA9Q16795 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NDUFA9Q16795 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NDUFA9Q16795 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
NDUFA9Q16795 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NDUFA9Q16795 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
NDUFA9Q16795 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NDUFA9Q16795 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NDUFA9Q16795 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NDUFA9Q16795 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NDUFA9Q16795 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NDUFA9Q16795 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NDUFA9Q16795 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NDUFA9Q16795 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NDUFA9Q16795 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NDUFA9Q16795 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC14.11□□□□□ -0.15
NDUFA9Q16795 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
NDUFA9Q16795 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
NDUFA9Q16795 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
NDUFA9Q16795 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
NDUFA9Q16795 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
NDUFA9Q16795 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC14.11□□□□□ -0.15
NDUFA9Q16795 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
NDUFA9Q16795 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
NDUFA9Q16795 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
NDUFA9Q16795 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
NDUFA9Q16795 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NDUFA9Q16795 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NDUFA9Q16795 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
NDUFA9Q16795 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
NDUFA9Q16795 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms