Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HIST3H3Q16695 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
HIST3H3Q16695 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
HIST3H3Q16695 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
HIST3H3Q16695 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
HIST3H3Q16695 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
HIST3H3Q16695 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
HIST3H3Q16695 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
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