Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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