Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FXNQ16595 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FXNQ16595 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FXNQ16595 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FXNQ16595 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FXNQ16595 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FXNQ16595 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FXNQ16595 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
FXNQ16595 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
FXNQ16595 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
FXNQ16595 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FXNQ16595 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FXNQ16595 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FXNQ16595 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
FXNQ16595 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FXNQ16595 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
FXNQ16595 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FXNQ16595 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FXNQ16595 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FXNQ16595 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FXNQ16595 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FXNQ16595 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FXNQ16595 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FXNQ16595 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FXNQ16595 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FXNQ16595 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FXNQ16595 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FXNQ16595 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
FXNQ16595 PARP3-202ENST00000417220 2472 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FXNQ16595 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FXNQ16595 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FXNQ16595 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FXNQ16595 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FXNQ16595 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FXNQ16595 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FXNQ16595 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
FXNQ16595 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
FXNQ16595 TGM1-201ENST00000206765 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
FXNQ16595 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
FXNQ16595 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
FXNQ16595 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
FXNQ16595 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
FXNQ16595 NOX5-202ENST00000388866 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
FXNQ16595 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FXNQ16595 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FXNQ16595 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FXNQ16595 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FXNQ16595 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FXNQ16595 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FXNQ16595 KIAA1191-202ENST00000393725 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FXNQ16595 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FXNQ16595 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FXNQ16595 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FXNQ16595 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FXNQ16595 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FXNQ16595 TCAF2-201ENST00000357344 2958 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FXNQ16595 APOBEC3H-202ENST00000401756 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FXNQ16595 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
FXNQ16595 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FXNQ16595 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FXNQ16595 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FXNQ16595 CD22-209ENST00000594250 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FXNQ16595 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
FXNQ16595 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
FXNQ16595 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FXNQ16595 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FXNQ16595 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
FXNQ16595 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FXNQ16595 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FXNQ16595 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FXNQ16595 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FXNQ16595 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FXNQ16595 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FXNQ16595 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FXNQ16595 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FXNQ16595 ELN-211ENST00000414324 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FXNQ16595 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FXNQ16595 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FXNQ16595 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FXNQ16595 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FXNQ16595 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FXNQ16595 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FXNQ16595 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FXNQ16595 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FXNQ16595 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FXNQ16595 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FXNQ16595 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FXNQ16595 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FXNQ16595 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FXNQ16595 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FXNQ16595 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FXNQ16595 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
FXNQ16595 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FXNQ16595 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FXNQ16595 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FXNQ16595 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FXNQ16595 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FXNQ16595 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FXNQ16595 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FXNQ16595 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms