Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
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RPE65Q16518 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
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RPE65Q16518 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
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RPE65Q16518 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
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RPE65Q16518 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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RPE65Q16518 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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RPE65Q16518 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
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RPE65Q16518 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
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RPE65Q16518 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
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RPE65Q16518 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
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RPE65Q16518 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
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