Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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