Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 GNAT1-202ENST00000433068 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 JAZF1-AS1-201ENST00000436758 548 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 AC083801.1-201ENST00000491689 358 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 GDNF-207ENST00000515058 764 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 NAV1-210ENST00000593583 726 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 SNX15-201ENST00000352068 771 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 MANEA-202ENST00000369293 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 TMEM95-202ENST00000389982 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 ATP5J-202ENST00000400087 826 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 AL583839.1-201ENST00000445280 691 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 HNRNPA1P42-201ENST00000458678 957 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 AC079949.1-201ENST00000541419 505 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 AP005899.1-201ENST00000579467 544 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 SNX11-210ENST00000582104 1282 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 DNAJC10-211ENST00000640034 888 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 RNLS-203ENST00000437752 525 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 BBS1-203ENST00000455748 1552 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC85BQ15834 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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