Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 CRHR1-205ENST00000352855 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 HDAC8-204ENST00000373560 819 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 HNRNPA1P58-201ENST00000403629 610 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NCOA1Q15788 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
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NCOA1Q15788 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
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NCOA1Q15788 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NCOA1Q15788 MIR6816-201ENST00000620368 66 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
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