Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SIX1Q15475 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SIX1Q15475 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SIX1Q15475 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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SIX1Q15475 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SIX1Q15475 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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SIX1Q15475 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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SIX1Q15475 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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SIX1Q15475 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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SIX1Q15475 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SIX1Q15475 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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SIX1Q15475 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SIX1Q15475 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SIX1Q15475 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SIX1Q15475 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SIX1Q15475 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
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