Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 GLUD1P3-201ENST00000507952 896 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 AC073569.2-201ENST00000551995 354 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 AC009055.1-201ENST00000562656 781 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 AC011489.1-201ENST00000586744 690 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 PHF23-213ENST00000613632 850 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 AQP7-202ENST00000377425 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 AC099567.1-201ENST00000414418 931 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 LINC00303-203ENST00000427799 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 HNRNPA1P56-201ENST00000505767 954 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 MIR2278-201ENST00000516344 96 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 AC006116.2-201ENST00000589958 988 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 AL645608.7-201ENST00000607769 351 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 AC004466.2-201ENST00000614749 516 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 CFAP36-204ENST00000406691 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 C7orf49-214ENST00000620897 1349 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 POLR2G-201ENST00000301788 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 HNRNPA1P21-201ENST00000424115 961 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 AC074389.3-201ENST00000450458 454 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 RN7SL351P-201ENST00000469306 248 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 KHDRBS3-206ENST00000520981 1243 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 LINC00301-203ENST00000527161 749 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 AP003031.2-205ENST00000531263 683 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 CTSH-218ENST00000615999 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 MIR6125-201ENST00000618986 96 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 CNMD-203ENST00000448904 1444 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 MAD2L1BP-202ENST00000451025 1517 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 DEDD-202ENST00000368006 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 SUCLA2-205ENST00000470760 1445 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 KRTAP6-1-201ENST00000329122 500 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 DYNLT1-201ENST00000367085 774 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 ACTBP14-201ENST00000411655 1089 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 ARSEP1-202ENST00000430152 499 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 CDK2-203ENST00000440311 1031 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 AL365500.1-201ENST00000442783 868 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 HOXC-AS3-203ENST00000514702 368 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 BAK1P2-201ENST00000532665 631 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 GABARAPL1-213ENST00000544284 531 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 AC007298.2-201ENST00000551849 862 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 AC092756.1-201ENST00000560248 448 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 SRP14-208ENST00000560773 468 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 MT3-202ENST00000561640 514 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 AC132825.4-202ENST00000578792 434 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 AL049840.2-201ENST00000602722 535 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 HIST1H3B-201ENST00000621411 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 CHRNA2-201ENST00000240132 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
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