Protein–RNA interactions for Protein: Q14153

FAM53B, Protein FAM53B, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53BQ14153 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms