Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HTR4Q13639 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HTR4Q13639 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HTR4Q13639 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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HTR4Q13639 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HTR4Q13639 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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HTR4Q13639 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HTR4Q13639 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HTR4Q13639 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HTR4Q13639 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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HTR4Q13639 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HTR4Q13639 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HTR4Q13639 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HTR4Q13639 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
HTR4Q13639 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HTR4Q13639 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HTR4Q13639 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HTR4Q13639 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HTR4Q13639 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HTR4Q13639 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HTR4Q13639 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HTR4Q13639 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HTR4Q13639 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HTR4Q13639 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HTR4Q13639 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HTR4Q13639 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HTR4Q13639 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
HTR4Q13639 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HTR4Q13639 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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HTR4Q13639 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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HTR4Q13639 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HTR4Q13639 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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HTR4Q13639 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HTR4Q13639 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HTR4Q13639 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HTR4Q13639 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
HTR4Q13639 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HTR4Q13639 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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HTR4Q13639 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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HTR4Q13639 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HTR4Q13639 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HTR4Q13639 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HTR4Q13639 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HTR4Q13639 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HTR4Q13639 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HTR4Q13639 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HTR4Q13639 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HTR4Q13639 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HTR4Q13639 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
HTR4Q13639 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HTR4Q13639 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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