Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CUL4BQ13620 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
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