Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MTMR3Q13615 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100 ms