Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
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