Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Length 168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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PMS2P3Q13401 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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PMS2P3Q13401 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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PMS2P3Q13401 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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PMS2P3Q13401 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
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PMS2P3Q13401 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PMS2P3Q13401 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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