Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
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ITGB3BPQ13352 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
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ITGB3BPQ13352 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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ITGB3BPQ13352 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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ITGB3BPQ13352 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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ITGB3BPQ13352 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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ITGB3BPQ13352 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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ITGB3BPQ13352 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
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