Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms