Protein–RNA interactions for Protein: Q12769

NUP160, Nuclear pore complex protein Nup160, humanhuman

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Length 1,436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP160Q12769 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NUP160Q12769 TCL1A-209ENST00000557043 980 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUP160Q12769 AP001462.1-201ENST00000594089 452 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NUP160Q12769 KF455155.1-201ENST00000604493 303 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NUP160Q12769 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUP160Q12769 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUP160Q12769 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUP160Q12769 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUP160Q12769 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUP160Q12769 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUP160Q12769 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUP160Q12769 ATP6V1C1-205ENST00000521514 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUP160Q12769 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUP160Q12769 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUP160Q12769 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUP160Q12769 ANXA3-202ENST00000503570 1524 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUP160Q12769 PHKG1-201ENST00000297373 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUP160Q12769 SPATS1-202ENST00000323108 1107 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUP160Q12769 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUP160Q12769 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUP160Q12769 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUP160Q12769 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NUP160Q12769 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUP160Q12769 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUP160Q12769 TRAPPC4-202ENST00000434101 794 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUP160Q12769 ZMIZ1-AS1-202ENST00000440151 814 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUP160Q12769 LINC01502-203ENST00000447907 880 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUP160Q12769 AC008494.1-201ENST00000497612 796 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
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NUP160Q12769 SMIM15-202ENST00000507416 584 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
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NUP160Q12769 AC087442.1-201ENST00000525563 249 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUP160Q12769 AC091588.3-201ENST00000583442 770 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUP160Q12769 ZNF724-202ENST00000597037 780 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUP160Q12769 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUP160Q12769 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUP160Q12769 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUP160Q12769 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUP160Q12769 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUP160Q12769 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUP160Q12769 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUP160Q12769 HNRNPC-205ENST00000553300 1375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUP160Q12769 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUP160Q12769 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUP160Q12769 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
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NUP160Q12769 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUP160Q12769 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUP160Q12769 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUP160Q12769 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUP160Q12769 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUP160Q12769 PHACTR1-203ENST00000379335 943 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUP160Q12769 AC231533.1-201ENST00000416061 925 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUP160Q12769 IFITM2-205ENST00000602569 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUP160Q12769 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
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NUP160Q12769 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
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NUP160Q12769 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
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NUP160Q12769 AL513478.2-202ENST00000621949 835 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUP160Q12769 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
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NUP160Q12769 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NUP160Q12769 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NUP160Q12769 SFXN4-201ENST00000355697 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NUP160Q12769 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 GYG2-201ENST00000353656 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 PGAP2-207ENST00000463452 931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 AC011676.3-201ENST00000520606 294 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 SLC13A2-205ENST00000545060 1276 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 AL139316.1-201ENST00000555643 568 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 EEF1DP7-201ENST00000580496 513 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 AC132812.1-201ENST00000583145 892 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 KRTAP10-4-202ENST00000616689 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 MIR8071-1-201ENST00000616769 65 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 MIR8071-2-201ENST00000616772 65 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 FCGR3A-208ENST00000638849 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
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